A II. Rákóczi Ferenc Megyei Könyvtár gyűjteménye napjainkban közel 585 ezer könyvtári dokumentumot számlál. Az állományában döntően magyar, és más idegen (angol, francia, német, olasz, orosz, spanyol, szlovák, bolgár, horvát, lengyel, örmény, román, szerb, szlovén, ukrán, ruszin) nyelvű gyermek, ifjúsági és felnőtt szép- és szakirodalmat szolgáltat.

A teljes állomány 80%-a könyv, 5%-a időszaki kiadvány, további 5%-a CD, DVD és különböző hangzó anyag. A 10% egyéb dokumentumtípus kottákat, térképeket, mikrofilmeket, kéziratokat tartalmaz.

A könyvtár állományának nagyobb részét a szakirodalmi művek képezik. A több mint 420 ezer dokumentum-tételben jelentő az alkalmazott tudományok, társadalomtudományok, művészetek témával foglalkozó irodalom. A szépirodalmi művek 23, a gyermekirodalom kötetei a teljes gyűjtemény 5%-át teszik ki.

A dokumentumok háromnegyed része vásárlás útján kerül az állományba, a fennmaradó rész kötelespéldány, ajándék, illetve kis részben csere.

A Megyei Könyvtár 1998 óta épít elektronikus katalógust, így az ettől az időponttól beszerzett dokumentumok a jelenleg használt Corvina OPAC-ban a könyvtári olvasói gépeken, illetve a http://opac.rfmlib.hu Internetcímen visszakereshetőek. Mivel a visszamenőleges feldolgozás még nem fejeződött be, így az 1998 előtt megjelent dokumentumok egy részét csak a cédula-katalógus tükrözi.

Az állomány az épület szintjein, szabadpolcos elrendezésben, illetve a központi raktárban található. A raktári dokumentumok az olvasói elektronikus katalógusok felületéről közvetlenül felkérhetők.

Az első emelet osztatlan terében a szépirodalmi művek a szerző, ennek hiányában a cím betűrendjében találhatóak. A szakkönyvek mindkét szinten szakszám szerinti besorolásban kerültek a polcokra. Az első emeleten az olvasótér két oldalán a kölcsönözhető videó-, DVD és hangoskönyv-választék böngészhető.

A Megyei Könyvtárban több különgyűjtemény található.

A Nyelvi részleg – mely a nemzetiségi állományt és a Gateway UK köteteit is tartalmazza – 1984-től áll szótárakkal, nyelvkönyvekkel, idegen nyelvű szak- és szépirodalmi munkákkal a nyelvek iránt érdeklődők rendelkezésére. A kölcsönzés feltételei a konkrét állományrésztől függően változnak.

A csendes munkára kialakított gyűjteménytől elválasztva a fiatalabb korosztály és szüleik által igen kedvelt, foglalkozásokra, könyvtári órákra is rendelkezésre álló Gyermekkönyvtár található. A modern technikára, újdonságokra leginkább fogékony korosztály használhatja az Intézményben először azt az új technológiát, amellyel a részleg megfelelő vonalkóddal (RFID) ellátott összes könyve önkiszolgáló módon kölcsönözhető. A visszavétel továbbra is a Kölcsönzőpultban történik.

A felső emeleten az egyedi, értékes, régi dokumentumokat őrző Helyismereti Gyűjtemény minden olvasó számára nyitott, állománya azonban nem kölcsönözhető. A gyűjteményben kutatható könyvek, folyóiratok, képeslapok, apró-nyomtatványok csakúgy, mint a cikk-adatbázis tételei helyben használhatóak vagy a könyvtárhasználati szabályzat szerint fénymásolhatók, esetleg szkennelt formában igényelhetők.

A szintén csak helyben használható teljes kézikönyvtári állományt a szakfolyóiratok és a hozzá tartozó olvasótér egészíti ki.

Az Európa Gyűjtemény 2004 óta gyűjti és szolgáltatja az Európai Unióval kapcsolatos, keresett szakirodalmat.

A modern hangtechnikai eszközökkel felszerelt Zenemű- és Hangtár 1974-től áll a látogatók rendelkezésére. A ma már több ezer hangzó dokumentumot, kottát, szakkönyvet szolgáltató részlegben a jelentős méretű bakelitlemez-állomány tételei között cédulakatalógusban lehet keresni.